Python、Rでフィッシャーの正確確率検定Fisher’s exact test on Python, R

フィッシャーの正確確率検定

フィッシャーの正確確率検定は、水準ごとの分割表データが得られたときに、その水準間の独立性を検定する手法です。

同じく分割表データの独立性の検定は、カイ二乗検定が用いられる場合もあります。

カイ二乗検定では、カイ二乗統計量がカイ二乗分布に近似できることから導出される手法ですが、データ数が少ないなどで近似が悪くなる場合には、こちらのフィッシャーの正確確率検定を用いることがあるようです。

参考: Python、Rでカイ二乗検定

Python

GitHub: https://github.com/Gin04gh/samples_py/blob/master/FisherExactTest.ipynb

R

GitHub: https://github.com/Gin04gh/samples_r/blob/master/FisherExactTest.ipynb