Python、Rでフィッシャーの正確確率検定Fisher’s exact test on Python, R

フィッシャーの正確確率検定

  • 独立性の検定
    • 観測されたデータを水準ごとに分けた時に、その水準間において関係があるかどうかを調べる
  • 同じく独立性の検定の手法として、カイ二乗検定がある
    • Python、Rでカイ二乗検定
    • カイ二乗検定では、カイ二乗統計量がカイ二乗分布に近似できることから導出されるが、データ数が少ないなどで近似が悪くなる場合には、こちらのフィッシャーの正確確率検定を用いることがある

Python(Scipy)

GitHub: https://github.com/Gin04gh/samples_py/blob/master/FisherExactTest.ipynb

R

GitHub: https://github.com/Gin04gh/samples_r/blob/master/FisherExactTest.ipynb